Μέσα στην παλιά πόλη, κρυμμένη στα ναυπλιώτικα σοκάκια, στην μικρή ομώνυμη πλατεία βρίσκεται η εκκλησία του Αγ. Σπυρίδωνα. Κτίστηκε το 1702, στα χρόνια της πρώτης Ενετοκρατίας, με χρήματα της Ναυτιλιακής Αδελφότητας Ορθόδοξων Ελλήνων. Πρόκειται για ναό μεταβυζαντινό σε σχήμα εγγεγραμμένου σταυρού με οκταγωνικό τρούλο. Διαθέτει αξιόλογες εικόνες, όπως αυτή της Αγ. Βαρβάρας.
Μπροστά από την εκκλησία, στις 27 Σεπτεμβρίου 1831 γράφτηκε μια από τις μελανότερες σελίδες της νεώτερης ελληνικής ιστορίας. Εδώ δολοφονήθηκε ο πρώτος κυβερνήτης της Ελλάδας Ιωάννης Καποδίστριας από τους Μανιάτες καπεταναίους Γεώργιο και Κωνσταντίνο Μαυρομιχάλη. Ο Καποδίστριας συνήθιζε να εκκλησιάζεται εδώ κάθε Κυριακή, καθώς ο ναός ήταν αφιερωμένος στον άγιο πολιούχο της γενέτειράς του Κέρκυρας. Στην είσοδο τον περίμεναν οι δυο δολοφόνοι που τον εκτέλεσαν με πιστόλι και μαχαίρι. Το θύμα πέθανε ακαριαία, ενώ ο Κωνσταντίνος λυντσαρίστηκε από το πλήθος των πιστών και ο Γεώργιος εκτελέστηκε λίγες μέρες αργότερα. Η κηδεία του Καποδίστρια έγινε στις 18 Οκτωβρίου 1831, αφού πρώτα η σορός του εκτέθηκε σε λαϊκό προσκύνημα. Τα σπλάχνα του τοποθετήθηκαν σε πολυτελή θήκη κάτω από το Ιερό Βήμα του ναού.